 |
| Vibrio cholerae |
Gammaproteobacteria, Pseudomonadota (Eş anlamlısı Proteobacteria) şubesinde yer alan bir bakteri sınıfıdır. Yaklaşık 250 cins içerir ve böylece Prokaryotların cins açısından en zengin taksonunu oluşturur. Tıbbi, ekolojik ve bilimsel açıdan önemli birçok bakteri grubu bu sınıfta yer alır. Tümü Gram-negatif bakterilerden oluşur ve filogenetik ve fizyolojik olarak en çeşitli Proteobacteria sınıfıdır.
Bu mikroorganizmalar, hidrotermal menfezler gibi aşırı ortamlar da dahil olmak üzere çeşitli karasal ve deniz ortamlarında yaşayabilirler. Genellikle farklı şekillere sahiptirler. Çubuklar, kavisli çubuklar, koklar, spirilla ve filamentler ve serbest yaşayan bakteriler, biyofilm oluşturucular, kommensaller ve simbiyotikleri içerir. Bazıları ayrıca biyolüminesan gösterme gibi ayırt edici özelliklere sahiptir. Farklı cinslerde bulunan bakterilerin metabolizmalar çok farklıdır; hem aerobik hem de anaerobik (zorunlu veya fakültatif) türler vardır. Ayrıcakemolitoototrofikler, kemoorganotrofikler, fotoototroflar ve heterotroflar türler de mevcuttur.
Bilimsel sınıflandırması
- Üst âlem: Bacteria (Bakteri)
- Şube: Proteobacteria
- Sınıf: Gammaproteobacteria
Takımlar
- Acidiferrobacterales Kojima et al. 2015
- Aeromonadales Martin-Carnahan and Joseph 2005
- Alteromonadales Bowman and McMeekin 2005
- Arenicellales Teramoto et al. 2015
- Cardiobacteriales Garrity et al. 2005
- Cellvibrionales Spring et al. 2015
- Chromatiales Imhoff 2005
- Enterobacterales Adeolu et al. 2016
- Immundisolibacterales Corteselli et al. 2017
- Legionellales Garrity et al. 2005
- Lysobacterales Christensen and Cook 1978 (Approved Lists 1980)
- Methylococcales Bowman 2005
- Nevskiales Naushad et al. 2015
- Oceanospirillales Garrity et al. 2005
- Orbales Kwong and Moran 2013
- Pasteurellales Garrity et al. 2005
- Pseudomonadales Orla-Jensen 1921 (Approved Lists 1980)
- Thiotrichales Garrity et al. 2005
- "Vibrionales" Garrity and Holt 2001
- Familya incertae sedis
- Thorselliaceae Kämpfer et al. 2015
- Cins incertae sedis
- Arsukibacterium Schmidt et al. 2016
- "Candidatus Azoamicus" Graf et al. 2021
- Litorivivens Park et al. 2015
- Plasticicumulans Jiang et al. 2011
Sinonimler
- "Chromatiia" Cavalier-Smith 2020
Etimoloji
" Gamma " (Yunan alfabesinin üçüncü harfi) öğesi, sınıfınBergey's Manual of Systematic Bacteriology (Cilt. II, sayfa 1) kitabına göre Sınıf III olduğunu belirtir. Proteus, şeklini değiştirebilen Yunan deniz tanrısını ifade eder. Bakteriler (Yunanca βακτήριον; "çubuk" "küçük çubuk"), etimolojik tarih açısından Basiller'e (çubuk şeklindeki bakteriler) atıfta bulunur.
Filogeni
Birçok farklı sınıflandırma farklı yaklaşımlara dayanmaktadır. Örneğin genomik temelli Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, İsimlendirmede Yer Alan Prokaryotik İsimler Listesi, ribozomal RNA'ya dayalı ARB-Silva Veritabanı veya bir çoklu protein yaklaşımı sınıflandırmalar vardır. Bu bakteri sınıfının soyoluşunu çözmek hala sorunludur.
Aşağıda, Gammaproteobacteria sınıfı için 356 protein ailesinden oluşan bir diziye dayanan bir sınıflama rapor edilmektedir.
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bazı bakteriler, Gammaproteobacteria'nın üyeleri olarak tanımlanmış ancak henüz bir takım veya aileye atanmamıştır. Bunlar, Alkalimonas, Gallaecimonas, Ignatzschineria, Litorivivens, Marinicella, Plasticicumulans, Pseudohongiella, Sedimenticola, Thiohalobacter, Thiohalorhabdus, Thiolapillus ve Wohlfahrtiimonas cinsi bakterileri içerir.
Patojenler
Gammaproteobacteria, Enterobacteriaceae, Vibrionaceae ve Pseudomonadaceae familyaları gibi tıbbi ve bilimsel açıdan önemli birkaç bakteri grubunu içermektedir. Yersinia pestis, Vibrio cholerae, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli ve bazı Salmonella türleri dahil olmak üzere bir dizi insan patojeni bu sınıftadırlar. Deniz ortamında, bu sınıftan birkaç tür, balıkları, karidesleri, mercanları veya istiridyeleri etkileyen Vibrio cinsi ve gri fokları (Halichoerus grypus ) etkileyen Salmonella türleri gibi farklı deniz organizmalarını enfekte etmektedir.