Cinsiyet ataması veya biyolojik cinsiyet ataması, kişinin doğumu sırasında dış üreme sistemi özelliklerine bakarak tıp tarafından cinsiyetinin belirlenmesidir. Doğumların büyük çoğunluğunda ebe, hemşire veya hekim tarafından bebeğin üreme sistemi kontrol edilerek ikili cinsiyet sistemindeki "kadın" veya "erkek" atamasından biri yapılır. Atama aynı zamanda doğum öncesi cinsiyet muhakemesi sayesinde doğumdan önce de gerçekleşebilir.
Atama terimi, ebeveynler veya sağlık uzmanları tarafından alınan bir kararı akla getirse de, bu yetişkinler kesinlikle çocuğa atanacak olan cinsiyeti seçmez. Bu eylem neredeyse evrensel olarak, bir bebeğin biyolojik bir yönünün gözlenmesi veya tanınması olarak düşülmektedir. Neredeyse tüm durumlarda, ebeveynler çocuğu atanmış cinsiyeti temel alarak yetiştirir.
Bazı durumlarda, atanmış cinsiyet veya buna ilişkin gözlem ve sonuçlar yanlış olabilir. Translık veya intersekslik gibi durumlarda, cinsiyet kimliği ile atanmış cinsiyeti uyumlu olmamaktadır. Bazı koşullarda, genellikle interseks olarak adlandırılan, iç anatomi dış anatomi gözlemine dayanarak alınan sonuçlarla uyumlu olmayabilir.